Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms