Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Bcl11bQ99PV8 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Bcl11bQ99PV8 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Bcl11bQ99PV8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Bcl11bQ99PV8 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Bcl11bQ99PV8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Bcl11bQ99PV8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Bcl11bQ99PV8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcl11bQ99PV8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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