Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim26Q99PN3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms