Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PtprtQ99M80 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Fhl3-202ENSMUST00000106199 1139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PtprtQ99M80 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PtprtQ99M80 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Gm2237-201ENSMUST00000112595 471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Gm15661-201ENSMUST00000117390 556 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PtprtQ99M80 Gm42875-201ENSMUST00000197674 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Crip1-205ENSMUST00000199089 509 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 8030423J24Rik-201ENSMUST00000022091 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PtprtQ99M80 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PtprtQ99M80 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PtprtQ99M80 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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PtprtQ99M80 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Atad3aos-204ENSMUST00000174185 482 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Ube2i-214ENSMUST00000174216 1144 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Ccdc28a-205ENSMUST00000174592 882 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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PtprtQ99M80 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Ift172-206ENSMUST00000201809 405 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Eif2b3-201ENSMUST00000070610 1369 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms