Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms