Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms