Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms