Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Apobec3Q99J72 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Apobec3Q99J72 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Apobec3Q99J72 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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Apobec3Q99J72 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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