Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcsapQ8QZT2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcsapQ8QZT2 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcsapQ8QZT2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135 ms