Protein–RNA interactions for Protein: Q8K341

Atat1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atat1Q8K341 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Atat1Q8K341 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atat1Q8K341 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atat1Q8K341 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atat1Q8K341 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Atat1Q8K341 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atat1Q8K341 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atat1Q8K341 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atat1Q8K341 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atat1Q8K341 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atat1Q8K341 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atat1Q8K341 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atat1Q8K341 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Atat1Q8K341 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Atat1Q8K341 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atat1Q8K341 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Atat1Q8K341 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Atat1Q8K341 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Atat1Q8K341 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Atat1Q8K341 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Atat1Q8K341 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Atat1Q8K341 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Atat1Q8K341 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Atat1Q8K341 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Atat1Q8K341 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atat1Q8K341 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atat1Q8K341 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms