Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms