Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ercc8Q8CFD5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ercc8Q8CFD5 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ercc8Q8CFD5 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ercc8Q8CFD5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ercc8Q8CFD5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ercc8Q8CFD5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ercc8Q8CFD5 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ercc8Q8CFD5 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ercc8Q8CFD5 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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