Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp47Q8BY87 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp47Q8BY87 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp47Q8BY87 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms