Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4aQ8BW72 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms