Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms