Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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