Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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