Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms