Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Spred1-202ENSMUST00000110901 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Asb11-202ENSMUST00000036858 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm45817-201ENSMUST00000212738 1757 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 2610020F03Rik-201ENSMUST00000180401 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Olfr1511-201ENSMUST00000078171 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms