Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ttbk1Q6PCN3 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ttbk1Q6PCN3 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ttbk1Q6PCN3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ttbk1Q6PCN3 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ttbk1Q6PCN3 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ttbk1Q6PCN3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ttbk1Q6PCN3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttbk1Q6PCN3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms