Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp49Q6P9L4 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp49Q6P9L4 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp49Q6P9L4 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp49Q6P9L4 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp49Q6P9L4 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp49Q6P9L4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Usp49Q6P9L4 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Usp49Q6P9L4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Usp49Q6P9L4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp49Q6P9L4 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Usp49Q6P9L4 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp49Q6P9L4 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp49Q6P9L4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Usp49Q6P9L4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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