Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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Tpm4Q6IRU2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Tpm4Q6IRU2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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