Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Krt40Q6IFX3 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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