Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms