Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms