Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fgd6Q69ZL1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms