Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcn1Q64347 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms