Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Defa17Q64016 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Defa17Q64016 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Defa17Q64016 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Defa17Q64016 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms