Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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