Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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