Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkciQ62074 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkciQ62074 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkciQ62074 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkciQ62074 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms