Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Atf3Q60765 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Atf3Q60765 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Atf3Q60765 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Atf3Q60765 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Atf3Q60765 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Atf3Q60765 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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