Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csnk2a1Q60737 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms