Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms