Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Prdm10Q3UTQ7 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Prdm10Q3UTQ7 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Prdm10Q3UTQ7 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Prdm10Q3UTQ7 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Prdm10Q3UTQ7 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Prdm10Q3UTQ7 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Prdm10Q3UTQ7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Prdm10Q3UTQ7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Prdm10Q3UTQ7 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Prdm10Q3UTQ7 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Prdm10Q3UTQ7 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Prdm10Q3UTQ7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Prdm10Q3UTQ7 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Prdm10Q3UTQ7 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm10Q3UTQ7 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128 ms