Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms