Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 1700019C18Rik-203ENSMUST00000222085 1766 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms