Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Trappc13Q3TIR1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms