Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbp8Q2V6D6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms