Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Tmprss11cQ1JRP2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Tmprss11cQ1JRP2 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Tmprss11cQ1JRP2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Tmprss11cQ1JRP2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Tmprss11cQ1JRP2 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Tmprss11cQ1JRP2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmprss11cQ1JRP2 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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