Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Itgb8Q0VBD0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Itgb8Q0VBD0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Itgb8Q0VBD0 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Itgb8Q0VBD0 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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