Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms