Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms