Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms