Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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