Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Thbs2Q03350 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Thbs2Q03350 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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