Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctnnb1Q02248 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms