Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms