Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms