Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms